MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p2ABAYE

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010402	A	6	6	101	106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010402	TAGA	2	8	143	150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010402	T	7	7	213	219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010402	A	6	6	287	292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010402	AGCGA	2	10	301	310	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010402	T	8	8	329	336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010402	A	6	6	358	363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010402	AGCGAA	2	12	380	391	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010402	AGCGA	2	10	407	416	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010402	ATT	2	6	452	457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010402	ATA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010402	A	6	6	648	653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010402	GA	3	6	664	669	50 %	0 %	50 %	0 %	169302981
14	NC_010402	ACTTAG	2	12	711	722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	169302981
15	NC_010402	AAC	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302981
16	NC_010402	TTG	2	6	750	755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169302981
17	NC_010402	ATCA	2	8	821	828	50 %	25 %	0 %	25 %	169302981
18	NC_010402	CG	3	6	889	894	0 %	0 %	50 %	50 %	169302981
19	NC_010402	A	6	6	914	919	100 %	0 %	0 %	0 %	169302981
20	NC_010402	CTG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302981
21	NC_010402	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302981
22	NC_010402	TAG	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302981
23	NC_010402	TAG	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302981
24	NC_010402	AGAA	2	8	1172	1179	75 %	0 %	25 %	0 %	169302981
25	NC_010402	AAAT	2	8	1254	1261	75 %	25 %	0 %	0 %	169302981
26	NC_010402	AGA	3	9	1341	1349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302981
27	NC_010402	T	6	6	1392	1397	0 %	100 %	0 %	0 %	169302981
28	NC_010402	A	7	7	1561	1567	100 %	0 %	0 %	0 %	169302981
29	NC_010402	A	6	6	1635	1640	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
30	NC_010402	A	6	6	1765	1770	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
31	NC_010402	ATC	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302982
32	NC_010402	AAG	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302982
33	NC_010402	TGA	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302982
34	NC_010402	A	7	7	1805	1811	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
35	NC_010402	A	6	6	1839	1844	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
36	NC_010402	GAA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302982
37	NC_010402	CAA	2	6	1872	1877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
38	NC_010402	CAG	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302982
39	NC_010402	CAC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302982
40	NC_010402	ACA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
41	NC_010402	CAA	2	6	1989	1994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302982
42	NC_010402	AAT	2	6	2013	2018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302982
43	NC_010402	CACAA	2	10	2119	2128	60 %	0 %	0 %	40 %	169302982
44	NC_010402	A	6	6	2127	2132	100 %	0 %	0 %	0 %	169302982
45	NC_010402	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302983
46	NC_010402	GCT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302983
47	NC_010402	GAA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302983
48	NC_010402	AAAAAG	2	12	2318	2329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	169302983
49	NC_010402	ATT	2	6	2343	2348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302983
50	NC_010402	TGA	2	6	2378	2383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010402	AAT	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010402	A	7	7	2412	2418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010402	TAT	2	6	2503	2508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010402	A	6	6	2591	2596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010402	ATAAA	2	10	2598	2607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010402	GTG	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010402	GAA	3	9	2635	2643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010402	T	7	7	2673	2679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010402	ATC	2	6	2745	2750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010402	A	8	8	2778	2785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010402	T	6	6	2804	2809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010402	ATT	2	6	2818	2823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302984
63	NC_010402	AAT	2	6	2831	2836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
64	NC_010402	TGC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169302984
65	NC_010402	CAT	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302984
66	NC_010402	ATG	2	6	2909	2914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
67	NC_010402	AAC	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
68	NC_010402	GTA	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
69	NC_010402	AGT	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
70	NC_010402	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302984
71	NC_010402	TCT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169302984
72	NC_010402	AATT	2	8	3208	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	169302984
73	NC_010402	ATCA	2	8	3266	3273	50 %	25 %	0 %	25 %	169302984
74	NC_010402	CAA	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
75	NC_010402	GTAG	2	8	3402	3409	25 %	25 %	50 %	0 %	169302984
76	NC_010402	GTAC	2	8	3486	3493	25 %	25 %	25 %	25 %	169302984
77	NC_010402	ACC	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169302984
78	NC_010402	T	6	6	3639	3644	0 %	100 %	0 %	0 %	169302984
79	NC_010402	TGA	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302984
80	NC_010402	CAA	2	6	3664	3669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302984
81	NC_010402	TGAA	2	8	3703	3710	50 %	25 %	25 %	0 %	169302984
82	NC_010402	T	7	7	3714	3720	0 %	100 %	0 %	0 %	169302984
83	NC_010402	TAA	2	6	3802	3807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
84	NC_010402	T	6	6	3836	3841	0 %	100 %	0 %	0 %	169302984
85	NC_010402	ATA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
86	NC_010402	ATA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302984
87	NC_010402	TGG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010402	CAA	2	6	3988	3993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010402	AGC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010402	A	7	7	4045	4051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010402	TGAT	2	8	4111	4118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010402	ACT	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010402	TAA	2	6	4177	4182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010402	T	6	6	4234	4239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010402	CTT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010402	AAT	2	6	4265	4270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010402	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010402	TA	3	6	4328	4333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010402	T	6	6	4346	4351	0 %	100 %	0 %	0 %	169302985
100	NC_010402	AGAC	2	8	4468	4475	50 %	0 %	25 %	25 %	169302985
101	NC_010402	GAA	2	6	4487	4492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302985
102	NC_010402	TGG	2	6	4536	4541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302985
103	NC_010402	TGA	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302985
104	NC_010402	ATC	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302985
105	NC_010402	GCAAG	2	10	4592	4601	40 %	0 %	40 %	20 %	169302985
106	NC_010402	CA	3	6	4645	4650	50 %	0 %	0 %	50 %	169302986
107	NC_010402	GCTT	2	8	4699	4706	0 %	50 %	25 %	25 %	169302986
108	NC_010402	TGA	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302986
109	NC_010402	CAA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169302986
110	NC_010402	CTTG	2	8	4845	4852	0 %	50 %	25 %	25 %	169302986
111	NC_010402	ATGA	2	8	4887	4894	50 %	25 %	25 %	0 %	169302986
112	NC_010402	ATGCT	2	10	4906	4915	20 %	40 %	20 %	20 %	169302986
113	NC_010402	A	6	6	4925	4930	100 %	0 %	0 %	0 %	169302986
114	NC_010402	TCA	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302986
115	NC_010402	G	6	6	4980	4985	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010402	TAG	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010402	TTATA	2	10	5033	5042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010402	GTT	2	6	5060	5065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010402	TAAA	2	8	5072	5079	75 %	25 %	0 %	0 %	169302987
120	NC_010402	TAC	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
121	NC_010402	TGA	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
122	NC_010402	ATTC	2	8	5305	5312	25 %	50 %	0 %	25 %	169302987
123	NC_010402	TAT	2	6	5343	5348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
124	NC_010402	AGGA	2	8	5357	5364	50 %	0 %	50 %	0 %	169302987
125	NC_010402	AAT	2	6	5386	5391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
126	NC_010402	GTG	2	6	5477	5482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169302987
127	NC_010402	TAC	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
128	NC_010402	CAG	2	6	5627	5632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169302987
129	NC_010402	CTC	2	6	5708	5713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169302987
130	NC_010402	AGA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169302987
131	NC_010402	ATA	2	6	5846	5851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169302987
132	NC_010402	ATG	2	6	5882	5887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
133	NC_010402	A	6	6	5970	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	169302987
134	NC_010402	TAT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
135	NC_010402	GATG	2	8	6000	6007	25 %	25 %	50 %	0 %	169302987
136	NC_010402	ATTA	2	8	6016	6023	50 %	50 %	0 %	0 %	169302987
137	NC_010402	TCA	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169302987
138	NC_010402	TC	3	6	6077	6082	0 %	50 %	0 %	50 %	169302987
139	NC_010402	ATG	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169302987
140	NC_010402	TA	3	6	6184	6189	50 %	50 %	0 %	0 %	169302987
141	NC_010402	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169302987
142	NC_010402	T	6	6	6232	6237	0 %	100 %	0 %	0 %	169302987
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.